Лаборатория иммунологии и разработки аллергенов

Изучение бактериальных аллергенов (антигенов) началось в 1964 году в КНИИЭМ когда по инициативе академика А.Д. Адо и директора института И.Е. Алатырцевой было создано новое научное направление: открыта первая в стране научная лаборатория по изучению аллергии при инфекционных заболеваниях. Впоследствии лаборатория преобразовалась в научно-производственный комплекс по разработке, клиническому изучению и производству аллергенов из условно-патогенных бактерий (гемолитического стафилококка, гемолитического стрептококка, кишечной палочки, протея мирабилис, энтрококка). Впоследствии спектр выпускаемых бактериальных аллергенов существенно обновился и расширился.

В настоящее время исследованием свойств бактериальных аллергенов занимается лаборатория иммунологии и разработки аллергенов, которая является прямой наследницей лаборатории иммунологии и биохимии, которая была организована в 1977 году и которую возглавил д.м.н. А.Н. Маянский.

 

Состав лаборатории:

ФИО

Должность

Учёная степень

Специальность

Тюрин Юрий Александрович

зав. лабораторией, ведущий научный сотрудник

Кандидат медицинских наук

Биохимия, Педиатрия,

Врач специалист по клинической лабораторной диагностике

Куликов Сергей Николаевич

ведущий научный сотрудник

Кандидат биологических наук

Биотехнология

Долбин Дмитрий Александрович

старший научный сотрудник

Кандидат биологических наук

Паразитология

Хайруллин Руслан Зуфарович

старший научный сотрудник

Кандидат биологических наук

Микробиология

Григорьева Татьяна Владимировна

младший научный сотрудник

нет

Химия полимеров, лаборант

 

Основные научные направления:

Исследование микрофлоры различных биотипов человека, в том числе кожи и слизистых с применением малди-тофф масс спектрометрических методов идентификации белков микроорганизмов.

Изучение токсин-ферментных комплексов (микробных секретируемых протеиназ), как факторов патогенности условно-патогенных бактерий. Определение ферментативного и токсигенного спектра у клинических штаммов бактерий, выделяемых на фоне различных патологических состояний, а также имеющих существенное эпидемиологическое значение.

Определение гуморальных антимикробных факторов иммунитета (антител) к ферментам инвазии бактерий и грибов, а также к целому ряду белковых токсинов, образуемых условно-патогенной микрофлора организма человека.

Изучение сенсибилизации к белково-ферментным комплексам бактерий и грибов у человека, методом определения sIgE в плазме и сыворотке крови.

Исследование мукозального иммунитета – определение секреторного иммуноглобулина А в ротовой жидкости и назальных смывах, а также некоторых антимикробных пептидов (АМП) методом иммуноферментного анализа.

 

Основные научные достижения лаборатории:

Разработаны методы определения факторов патогенности бактерий. В том числе протеиназ, оксидоредкутаз, адгезинов и некоторых других.

Разработаны оригинальные методы определения белков – маркеров аллергических реакций – в секретах слизистых.

Разработаны иммуноферментные методы определения специфических антител к белковым фермент-токсиновым комплексам условно-патогенных бактерий и некоторых плесневых грибов.

Разработаны молекулярно-генетические методы анализа на основе мультиплексной ПЦР, позволяющие детектировать в геноме грамположительных бактерий мобильные элементы генома и локусы, ответственных за антибиотикорезистентность штаммов (детекция SCCmec, mecA гена у штаммов метицилинрезистентных стафилококков).

Разработаны молекулярно-генетические методы анализа на основе мультиплексной ПЦР, позволяющие детектировать в геноме грамположительных бактерий (стафилококков, стрептококков) гены экзотоксинов (set)

Разработаны молекулярно-генетические методы типирования штаммов Streptococcus pneumoniae методом Мультиплексной ПЦР.

 

Перечень видов научно-исследовательской деятельности, предлагаемой на договорной основе:

Характеристика факторов патогенности отдельных штаммов различных видов бактерий.
Определение антибактериальной активности соединений природного и искусственного происхождения.

 

Гранты

1. Создание новых антибактериальных и антигрибных препаратов на основе модифицированных хитозанов. РФФИ-09-04-99035 р_офи. (2009-2010гг);

2. Создание бионанокомпозитов на основе природных полисахаридов и их биологическая активность в отношении живых систем. РФФИ-12-04-97039-р_поволжье_а. (2012-2014гг);

3. Модуляция действия биоцидных веществ хитоолигосахаридами. РФФИ №15-34-50158 мол_нр. (2015г).

 

Патенты

Способ получения низкомолекулярного хитозана, растворимого в щелочных условиях»/ Куликов С.Н., Тюрин Ю.А., Долбин Д.А., Фассахов Р.С., Решетникова И.Д. // №2384588. Дата публикации 20.03.2010.

Способ определения IgG-протеиназной активности Тюрин Ю.А., Куликов С.Н.,  Фассахов Р.С., Долбин Д.А., Баязитова Л.Т. // №2373538. Дата публикации 20.11.2009.

Способ определения хитиназо-подобного белка YKL-40 в биоптатах и экскретах человека / Куликов С.Н., Тюрин Ю.А., Фассахов Р.С.  // №2423707. Дата публикации 10.07.2011.

Способ получения низкомолекулярного хитозана в бессолевой среде путём ферментативной деполимеризации / Куликов С.Н., Тюрин Ю.А., Фассахов Р.С., Ильина А.В., Варламов В.П., Албулов А.И. //   №2425844. Дата публикации 10.08.2011

Способ диагностики аскаридоза у человека / Долбин Д.А., Фассахов Р.С., Тюрин Ю.А., Решетникова И.Д., Новожилова А.А., Агафонова Е.В., Хайруллин Р.М., Куликов С.Н. // №2368324. Дата публикации 27.09.2009.

Способ диагностики лямблиозной инвазии / Долбин Д.А., Тюрин Ю.А., Фассахов Р.С., Агафонова Е.В., Решетникова И.Д., Куликов С.Н. // №2371719. Дата публикации 27.10.2009.

Способ определения адгезии Staphylococcus spp. к гемопротеинам / Тюрин Ю.А., Фассахов Р.С., Мустафин И.Г. // Патент №2393229. Дата публикации 02.02 2010.

Способ определения IgA-протеиназной активности / Тюрин Ю.А., Куликов С.Н.,  Мустафин И.Г., Фассахов Р.С. // №2426126. Дата публикации 10.08.2011.

Способ определения антибактериальной активности хитозана / Куликов С.Н., Филиппова Ю.А., Шакирова Д.Р., Фассахов Р.С., Ильина А.В., Варламов В.П. // Патент №2450022. Дата публикации 10.05.2012

Способ выявления яиц гельминтов, клещей и ооцист простейших в пробах почвы Лутфуллин М.Х., Долбин Д.А., Хамзина Е.В., Лутфуллина Н.А., Идрисов  А.М. / Дата публикации 2012г. Патент №2466388.

Способ экспресс-определения антибактериального потенциала хитозана в отношении // Патент №2488116. Опубликовано 20.07.2013.

Антибактериальная композиция, включающая водорастворимый низкомолекулярный хитозан / Куликов С.Н., Тихонов В.Е., Фассахов Р.С. // Патент №2494746. Дата публикации 10.10.2013.

Способ экспресс-определения адгезивных свойств бактерий / Куликов С.Н., Хайруллин Р.М., Фассахов Р.С. // №2537128. Дата публикации 27.12.2014.

Высокочувствительный и высокоспецифический способ детекции IgG-протеиназной активности с использованием полимерных матриц /  Куликов С.Н., Тюрин Ю.А., Хайруллин Р.М., Фассахов Р.С. // №2519071. Дата публикации 11.04.2014.

Способ идентификации генов стафилококковых экзотоксинов, с высокой структурной гомологией с суперантигенами, методом мультиплексной полимеразной цепной реакции и тест-система для его осуществления / Тюрин Ю.А., Фассахов Р.С. // №2532225. Дата публикации 27.10.2014.

Способ определения протеолитической модификации клеточных рецепторов на модели выделения лимфоцитов периферической крови / Тюрин Ю.А., Мустафин И.Г., Фассахов Р.С. // №2510026 Дата публикации 20.03.2014.

Способ культивирования личинок нематод подотряда Ascaridata /Долбин Д.А., Тюрин Ю.А., Лутфуллин М.Х., Крайнов В.В. // №2580655 Дата публикации 10.04.2016. 

 

Публикации:

Тюрин Ю.А., Долбин Д.А. / Роль факторов патогенности золотистого стафилококка в развитии атопического дерматита // ЖМЭИ, 2008, №4, с.105-110.

Агафонова Е.В., Долбин Д, А,, Куликов С.Н., Тюрин Ю.А. / Современные аспекты диагностики лямблиоза у человека // Русский медицинский журнал, 2008, Т. 16,№ 17, с. 1120-1123.

Ильина А.В., Куликов С.Н., Чаленко Г.И., Герасимова Н.Г., Варламов В.П. / Получение и исследование моносахаридных производных низкомолекулярного хитозана // Прикладная Биохимия и Микробиология, 2008, Т. 44, №5, с. 606-614.

Куликов С.Н., Тюрин Ю.А., Долбин Д.А., Фассахов Р.С. Хитин и хитиназы при аллергических реакциях // Российский Аллергологический Журнал, 2009, № 1. с. 18-23.

Лопатин С.А., Дербенева М.С., Куликов С.Н., Варламов В.П., Шпигун О.А. / Фракционирование хитозана методом ультрафильтрации // Журнал аналитической Химии, 2009, Т. 64, № 6, с. 666-670.

Тюрин Ю.А., Сукманская Е.О., Куликов С.Н., Фассахов Р.С. Хитиназоподобный белок YKL-40 назального секрета как потенциальный биомаркер при персистирующем аллергическом рините. // Российский Аллергологический Журнал, 2012., №4. с.13-18.

Тюрин Ю.А., Мустафин И.Г., Фассахов Р.С. Действие супернатантов штаммов Staphylococcus aureus на поверхностные рецепторы лимфоцитов человека. // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2012, Т. 154, №12 с. 733-737.

Kulikov S., Tikhonov V., Blagodatskikh I., Bezrodnykh E., Lopatin S., Khairullin R., Philippova Y., Abramchuk S. / Molecular weight and pH aspects of efficacy of oligochitosan against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) // Carbohydrate Polymers, 2012, 87, 545-550.

 Тюрин Ю.А., Баязитова Л.Т., Тюпкина О.Ф., Фассахов Р.С. / SCCmec-типирование метициллинрезистентных штаммов Staphylococcus aureus, выделенных от госпитализированных и амбулаторных пациентов в Казани // Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия, 2013, Т.15., №1. С.66-71.

Тюрин Ю.А., Шарифуллина А.А., Мустафин И.Г., Фассахов Р.С. / Содержание эпителиоцитов, экспрессирующих tlr-2, и состояние бактериоценоэа слизистой носа при различных формах аллергического ринита // Российский аллергологический журнал. 2013. № 6. С. 20-24.

Blagodatskikh I., Kulikov S., Vyshivannaya O., Bezrodnykh E.,  Yamskov I., Tikhonov V. / Influence of D-glucosamine on the oligochitosan (short-chain chitosan) solubility and antibacterial activity // Carbohydrate Research, 2013, V.381. 28-32.

Шамсутдинов А.Ф., Тюрин Ю.А. / Белковые токсины Staphylococcus aureus // Журнал Микробиологии, Эпидемиологии и Иммунобиологии, 2014, № 2. С.113-120.

Куликов С.Н., Тихонов В.Е., Безродных Е.А., Лопатин С.А., Варламов В.П. Сравнительная оценка антибактериальной активности хитозана в отношении Klebsiella pneumoneae // Биоорганическая Химия, 2015, Т.41., №1. 67-73.

Khaidarov T.F.,  Dolbin D.A.,  Kravtsova O.A.,  Tuchbatova R.I. / Biological aspects of the historical urban development of Jochi Ulus (Latter half of the 13-14th centuries) // The Social Sciences, 2015, V. 10, Iss. 6. p. 1047-1053. DOI: 10.3923/sscience.2015.1047.1053

Куликов С.Н., Хайруллин Р.З., Варламов В.П. / Влияние поликатионов на антибактериальную активность лизостафина // Прикладная биохимия и микробиология 2015. Т.51. №6. с.610-615.

Шагдарова Б.Ц., Куликов С.Н., Варламов В.П. / Изучение совместного действия производных хитозана с лизостафином и варнерином на клетки стафилококков // Известия Уфимского научного центра РАН, Уфа, 2015, №4 (1), с. 177-180. 

Долбин Д. А., Мингалеев Д. Н., Лутфуллин М. Х., Идрисов А. М. Сравнительное изучение эффективности различных средств, применяемых для дезинвазии лабораторных помещений. // Научно-практический журнал, Ученые записки КГАВМ. - Т. 219. - 2015. - С. 144 - 148.

Тюрин Ю.А., Хайруллин Р.З., Салафутдинов И.И. / Масс-спектрометрическая идентификация стафилококковых пептид-гидролаз // Вестник технологического университета. -2015. -Т.18. -№16. -С.287-290.

Долбин Д.А., Хайруллин Р.З. / Анализ эффективности использования современных средств для дезинвазии // Вестник технологического университета. 2015. Т.18. No 16. - С. 314 - 315.

Долбин Д.А., Хайруллин Р.З. / Изучение влияние ряда химических, физических и биологических факторов окружающей среды на эффективность дезинвазии помещений // Вестник технологического университета. -2015. -Т.18. - №15. -С.261-264.

Тюрин Ю.А., Фассахов Р.С., Григорьева Т.В., Мустафин И.Г. / Microbial composition of various surfaces of skin during development of atopic dermatitis based on data from MALDI-TOF mass-spectrometry identification method // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологию 2016. №2. с.30-36.

Шамсутдинов А.Ф., Тюрин Ю.А., Баязитова Л.Т., Ризванов А.А., Шарифуллина А.А. / Распространённость токсигенных штаммов Staphylococcus aureus при атопическом дерматите // Практическая медицина. 2016. №3 (95) с.68-72.

Kulikov S.N., Bayazitova L.T., Tyupkina O.F., Zelenikhin P.V., Salnikova M.M., Bezrodnykh E.A., Tikhonov V.E. / Evaluation of a method for the determination of antibacterial activity of chitosan // Applied Biochemistry and Microbiology, 2016, Vol. 52, No. 5, pp. 502–507.

Kulikov S., Zelenikhin P., Murtazina R., Khayrullin R., Bezrodnikh E., Tikhonov V. / Article title: Induction of apoptosis of tumor cells by oligochitosans (short chain chitosans) / BioNanoScience, 2016, DOI: 10.1007/s12668-016-0243-8

Баязитова Л.Т., Тюпкина О.Ф., Чазова Т.А., Тюрин Ю.А., Шамсутдинов А.Ф., Решетникова И.Д., Тюрина Н.Ю. / Фенотипические особенности антибиотикорезистентности амбулаторных и госпитальный штаммов Staphylococcus aureus // Практическая медицина, 2016, 5(97). С.25-29

Blagodatskikh I.V., Kulikov S.N., Vyshivannaya O.V., Bezrodnykh E.A., Tikhonov V.E. / N-Reacetylated Oligochitosan: pH dependence of Self-Assembly Properties and Antibacterial Activity // Biomacromolecules 2017 18 (5), pp 1491–1498

Tyurin Yu.A., Shamsutdinov A.F., Kalinin N.N., Sharifullina A.A., Reshetnikova I.D. / Assotiation of toll-like cell receptors TLR2 (p.Arg753GLN) and TLR4 (p.Asp299GLY) polymorphisms with indicators of general and local immunity in patients with atopic dermatitis // Journal of Immunology Research, 2017, Article ID 8493545, 6 pages https://doi.org/10.1155/2017/8493545